Gossypium raimondii in family CE10 thmm coord ali coord ID Family tlen qlen E-Value from to from to Gorai.010G081500.1 CE10 341 348 0.00033 172 303 122 283 Gorai.010G111600.1 CE10 341 309 0.0031 147 204 120 181 Gorai.010G215600.1 CE10 341 333 0 73 314 55 305 Gorai.010G233300.1 CE10 341 175 0.000068 146 278 24 118 Gorai.010G114500.1 CE10 341 311 0 66 330 36 304 Gorai.010G016900.1 CE10 341 719 1.9e-26 93 322 474 691 Gorai.010G108500.1 CE10 341 467 0.0000035 37 215 153 345 Gorai.010G127700.1 CE10 341 194 0.000087 146 277 19 112 Gorai.010G151200.1 CE10 341 317 0.000027 146 321 109 299 Gorai.010G108400.1 CE10 341 420 0.000049 40 238 111 330 Gorai.010G227200.1 CE10 341 257 0.0000044 83 103 25 42 Gorai.010G227200.1 CE10 341 257 0.0000044 158 308 107 232 Gorai.010G227200.2 CE10 341 254 0.0000037 83 103 25 42 Gorai.010G227200.2 CE10 341 254 0.0000037 158 308 107 229 Gorai.009G292500.1 CE10 341 302 0.000091 94 210 44 160 Gorai.009G129700.1 CE10 341 257 0.00000012 83 103 25 42 Gorai.009G129700.1 CE10 341 257 0.00000012 158 308 107 232 Gorai.009G129700.2 CE10 341 217 0.00000022 158 308 67 192 Gorai.009G210800.1 CE10 341 336 0 68 335 44 320 Gorai.009G070500.1 CE10 341 223 0.0000088 124 190 61 128 Gorai.009G266900.1 CE10 341 357 0.000000026 93 193 63 182 Gorai.009G266900.2 CE10 341 343 0.00021 127 193 88 168 Gorai.009G266900.3 CE10 341 327 0.000000022 93 193 63 182 Gorai.009G196500.1 CE10 341 406 0.0023 72 103 74 116 Gorai.009G196500.1 CE10 341 406 0.0023 167 215 178 223 Gorai.009G054100.3 CE10 341 209 0.0021 146 205 52 115 Gorai.009G044400.1 CE10 341 287 0.00075 147 309 94 248 Gorai.009G044400.3 CE10 341 279 0.00067 147 309 86 240 Gorai.009G044400.4 CE10 341 241 0.00046 147 310 48 209 Gorai.009G044400.5 CE10 341 203 0.0003 147 310 10 172 Gorai.009G088900.2 CE10 341 508 0.00054 146 211 165 226 Gorai.009G088900.1 CE10 341 508 0.00054 146 211 165 226 Gorai.009G054400.1 CE10 341 502 0.000021 144 210 156 230 Gorai.009G054400.2 CE10 341 447 0.000017 144 210 156 230 Gorai.009G181800.1 CE10 341 270 0.0000000000013 143 311 125 250 Gorai.009G181800.2 CE10 341 259 0.00000000071 143 208 125 191 Gorai.009G210700.1 CE10 341 320 0 76 334 52 318 Gorai.N020400.2 CE10 341 308 0 55 290 51 300 Gorai.N020400.1 CE10 341 308 0 55 290 51 300 Gorai.N020400.3 CE10 341 264 0 58 290 10 256 Gorai.N020400.4 CE10 341 264 0 58 290 10 256 Gorai.004G217500.1 CE10 341 268 0.00000059 68 206 35 169 Gorai.004G245200.3 CE10 341 426 0.0046 170 206 189 223 Gorai.004G244100.1 CE10 341 345 0 58 332 54 339 Gorai.004G214300.1 CE10 341 346 0 81 316 76 326 Gorai.004G090200.1 CE10 341 373 0.000012 97 135 33 68 Gorai.004G090200.1 CE10 341 373 0.000012 171 329 137 313 Gorai.004G090200.2 CE10 341 345 0.0000000059 97 329 33 285 Gorai.004G090200.3 CE10 341 274 0.000082 171 330 38 215 Gorai.004G265600.1 CE10 341 335 0 54 336 47 332 Gorai.004G265700.1 CE10 341 284 0 58 288 29 265 Gorai.007G054400.1 CE10 341 479 0.0033 141 184 265 303 Gorai.007G054400.2 CE10 341 473 0.0033 141 184 259 297 Gorai.007G284500.1 CE10 341 354 0.00051 174 291 124 265 Gorai.007G029500.1 CE10 341 511 0.00016 152 189 307 344 Gorai.007G029500.2 CE10 341 483 0.00013 152 190 307 345 Gorai.007G025600.2 CE10 341 234 0.0025 93 190 25 128 Gorai.007G025600.2 CE10 341 234 0.0025 292 336 181 231 Gorai.007G025600.1 CE10 341 234 0.0025 93 190 25 128 Gorai.007G025600.1 CE10 341 234 0.0025 292 336 181 231 Gorai.007G093200.1 CE10 341 348 0 71 324 57 320 Gorai.007G128100.1 CE10 341 356 0.00000014 119 316 62 282 Gorai.007G128100.2 CE10 341 348 0.000000016 94 316 32 274 Gorai.007G054600.1 CE10 341 484 0.0013 141 184 262 300 Gorai.007G054600.2 CE10 341 398 0.001 141 184 262 300 Gorai.007G074300.1 CE10 341 444 0 57 336 110 433 Gorai.007G074300.2 CE10 341 416 0 57 296 110 393 Gorai.007G132800.2 CE10 341 345 0 80 316 75 326 Gorai.007G132800.1 CE10 341 345 0 80 316 75 326 Gorai.007G202800.1 CE10 341 316 0.0035 93 103 51 69 Gorai.007G202800.1 CE10 341 316 0.0035 167 216 127 188 Gorai.007G301300.1 CE10 341 327 0 53 335 26 323 Gorai.007G301300.2 CE10 341 233 1.54143e-44 53 233 26 227 Gorai.007G180400.1 CE10 341 342 0 66 331 54 336 Gorai.013G079100.1 CE10 341 463 5.60519e-45 67 316 162 411 Gorai.013G079100.2 CE10 341 415 3.3e-36 67 208 162 313 Gorai.013G079100.2 CE10 341 415 3.3e-36 285 316 332 363 Gorai.013G226300.1 CE10 341 319 0.000000045 115 308 97 275 Gorai.013G226300.3 CE10 341 317 0.000000045 115 308 97 275 Gorai.013G226300.4 CE10 341 314 0.000000044 115 308 97 275 Gorai.013G226300.2 CE10 341 313 0.000000044 115 308 97 275 Gorai.013G226300.5 CE10 341 312 0.000000044 115 308 97 275 Gorai.013G226300.6 CE10 341 309 0.000000043 115 308 97 275 Gorai.013G226300.7 CE10 341 308 0.000000043 115 308 97 275 Gorai.013G042500.1 CE10 341 305 3.8e-38 67 332 46 298 Gorai.013G254800.1 CE10 341 266 0.00064 95 202 24 127 Gorai.013G254800.2 CE10 341 243 0.00052 95 202 24 127 Gorai.013G249300.1 CE10 341 222 0.000000023 76 190 15 127 Gorai.013G249300.1 CE10 341 222 0.000000023 288 308 178 198 Gorai.013G075000.1 CE10 341 316 0.0038 94 155 24 90 Gorai.013G254600.1 CE10 341 318 0.0011 95 202 24 127 Gorai.013G203500.1 CE10 341 345 0 55 333 51 340 Gorai.013G203500.2 CE10 341 301 0 58 333 10 296 Gorai.002G237800.5 CE10 341 452 0.0026 170 208 187 224 Gorai.002G237800.6 CE10 341 437 0.0025 170 208 187 224 Gorai.002G237800.3 CE10 341 437 0.0025 170 208 187 224 Gorai.002G190500.1 CE10 341 402 0 81 336 70 391 Gorai.002G093100.1 CE10 341 286 0.0025 147 215 98 190 Gorai.002G057200.1 CE10 341 325 0.0000053 171 334 136 315 Gorai.002G057200.2 CE10 341 320 0.000005 171 334 131 310 Gorai.003G140500.1 CE10 341 269 4.60046e-42 53 249 45 253 Gorai.003G140500.2 CE10 341 228 6.39973e-42 57 249 8 212 Gorai.003G152800.1 CE10 341 127 0.000033 106 188 14 96 Gorai.003G176400.1 CE10 341 470 0.00055 151 190 296 335 Gorai.003G033300.1 CE10 341 540 0.00047 169 209 226 265 Gorai.003G033300.2 CE10 341 509 0.00044 169 209 183 222 Gorai.005G239100.1 CE10 341 321 0 58 334 34 316 Gorai.005G239400.1 CE10 341 307 0 63 333 43 304 Gorai.005G239000.1 CE10 341 332 0 62 336 38 318 Gorai.005G148400.1 CE10 341 1653 0.0023 161 193 1437 1470 Gorai.005G148400.2 CE10 341 1586 0.0027 161 193 1485 1517 Gorai.005G148400.3 CE10 341 1529 0.0023 161 193 1313 1346 Gorai.005G148400.4 CE10 341 1525 0.0022 161 193 1309 1342 Gorai.005G148400.5 CE10 341 1404 0.0022 161 193 1188 1221 Gorai.005G148400.6 CE10 341 860 0.0012 161 193 644 677 Gorai.005G148400.7 CE10 341 856 0.0012 161 193 640 673 Gorai.005G148400.8 CE10 341 745 0.0013 161 193 644 676 Gorai.005G148400.9 CE10 341 745 0.0013 161 193 644 676 Gorai.005G040200.1 CE10 341 239 0.0019 119 209 60 156 Gorai.005G040200.1 CE10 341 239 0.0019 238 318 107 215 Gorai.005G036200.1 CE10 341 773 0.003 169 190 706 728 Gorai.005G239200.1 CE10 341 315 0 62 316 38 300 Gorai.005G103700.1 CE10 341 329 0 69 334 45 319 Gorai.005G103600.1 CE10 341 244 2.4e-35 58 151 34 130 Gorai.005G103600.1 CE10 341 244 2.4e-35 240 314 157 233 Gorai.011G168000.3 CE10 341 585 0.0000011 84 212 33 176 Gorai.011G168000.1 CE10 341 585 0.0000011 84 212 33 176 Gorai.011G168000.4 CE10 341 585 0.0000011 84 212 33 176 Gorai.011G168000.2 CE10 341 500 0.00000088 84 212 33 176 Gorai.011G093200.1 CE10 341 449 0 38 336 101 438 Gorai.011G170100.1 CE10 341 311 0.0002 78 133 36 85 Gorai.011G170100.1 CE10 341 311 0.0002 168 206 126 165 Gorai.011G080600.1 CE10 341 255 0.000078 83 103 25 42 Gorai.011G080600.1 CE10 341 255 0.000078 169 308 121 232 Gorai.011G192300.1 CE10 341 387 0.00003 93 208 87 201 Gorai.011G192300.2 CE10 341 324 0.000021 93 208 85 201 Gorai.011G116900.1 CE10 341 337 0 51 324 41 315 Gorai.011G245500.1 CE10 341 325 0.0000018 94 330 37 294 Gorai.008G025200.1 CE10 341 304 0 63 316 39 285 Gorai.008G139300.1 CE10 341 965 0.0000049 71 108 649 689 Gorai.008G139300.1 CE10 341 965 0.0000049 165 315 762 888 Gorai.008G139300.3 CE10 341 963 0.000014 71 108 649 689 Gorai.008G139300.3 CE10 341 963 0.000014 165 313 762 887 Gorai.008G139300.2 CE10 341 962 0.0000049 71 108 649 689 Gorai.008G139300.2 CE10 341 962 0.0000049 165 315 762 888 Gorai.008G139300.5 CE10 341 831 0.0000035 71 108 518 558 Gorai.008G139300.5 CE10 341 831 0.0000035 165 315 631 757 Gorai.008G139300.4 CE10 341 586 0.0000014 71 108 273 313 Gorai.008G139300.4 CE10 341 586 0.0000014 165 315 386 512 Gorai.008G184600.1 CE10 341 339 0 63 328 57 330 Gorai.008G292500.1 CE10 341 391 0.00016 9 103 56 147 Gorai.008G292500.1 CE10 341 391 0.00016 144 208 192 251 Gorai.008G072700.1 CE10 341 262 0.0000095 168 263 73 170 Gorai.008G282100.1 CE10 341 342 0 57 332 45 327 Gorai.008G054000.1 CE10 341 338 0 64 326 52 327 Gorai.008G055800.1 CE10 341 381 0.0000000064 94 332 109 370 Gorai.008G007200.1 CE10 341 345 0 70 317 66 327 Gorai.008G022600.1 CE10 341 424 0.0013 145 208 153 210 Gorai.008G022600.2 CE10 341 406 0.0012 145 208 153 210 Gorai.008G022600.3 CE10 341 403 0.0012 145 208 153 210 Gorai.001G062700.2 CE10 341 396 0.000024 146 291 120 227 Gorai.001G062700.2 CE10 341 396 0.000024 28 59 291 322 Gorai.001G062700.1 CE10 341 396 0.000024 146 291 120 227 Gorai.001G062700.1 CE10 341 396 0.000024 28 59 291 322 Gorai.001G062700.3 CE10 341 379 0.000022 146 291 103 210 Gorai.001G062700.3 CE10 341 379 0.000022 28 59 274 305 Gorai.001G173200.1 CE10 341 319 2.20004e-43 65 316 39 304 Gorai.001G268100.1 CE10 341 449 0 49 336 107 438 Gorai.001G226400.1 CE10 341 238 0.00013 146 208 30 86 Gorai.001G011000.1 CE10 341 348 0.000089 171 303 121 283 Gorai.001G011000.2 CE10 341 307 0.000068 172 303 81 242 Gorai.001G011000.3 CE10 341 294 0.000059 171 303 67 229 Gorai.001G011000.8 CE10 341 294 0.000059 171 303 67 229 Gorai.001G011000.6 CE10 341 282 0.00027 171 291 121 265 Gorai.001G030800.1 CE10 341 493 0.000064 147 211 153 225 Gorai.001G030800.2 CE10 341 485 0.000062 147 211 153 225 Gorai.001G082500.1 CE10 341 434 8.40779e-45 67 333 124 388 Gorai.001G082500.2 CE10 341 424 7.00649e-45 67 333 124 388 Gorai.001G082500.5 CE10 341 376 2.24208e-44 67 309 124 365 Gorai.001G082500.6 CE10 341 365 2.5e-37 67 288 124 344 Gorai.001G082500.7 CE10 341 354 4.2039e-45 67 333 54 318 Gorai.001G082500.8 CE10 341 347 4.5e-37 67 284 124 340 Gorai.001G082500.10 CE10 341 335 2.8026e-45 67 333 35 299 Gorai.001G082500.3 CE10 341 330 4.2039e-45 67 333 30 294 Gorai.001G082500.4 CE10 341 316 2.8026e-45 67 333 16 280 Gorai.001G082500.9 CE10 341 225 1.5e-24 146 333 2 189 Gorai.001G082500.11 CE10 341 225 1.5e-24 146 333 2 189 Gorai.001G197600.1 CE10 341 286 0.0000000016 141 204 131 185 Gorai.001G197600.1 CE10 341 286 0.0000000016 284 316 219 251 Gorai.001G197600.2 CE10 341 279 0.0000001 141 184 131 168 Gorai.001G197600.2 CE10 341 279 0.0000001 284 316 212 244 Gorai.012G091000.1 CE10 341 382 0 65 336 56 371 Gorai.012G136300.1 CE10 341 756 0.0000026 167 296 593 707 Gorai.012G136300.2 CE10 341 702 0.00086 167 273 593 682 Gorai.012G136300.3 CE10 341 696 0.00074 167 274 593 683 Gorai.012G002400.1 CE10 341 549 0.00000001 203 279 154 242 Gorai.012G002400.1 CE10 341 549 0.00000001 145 309 390 526 Gorai.012G002400.3 CE10 341 549 0.00000001 203 279 154 242 Gorai.012G002400.3 CE10 341 549 0.00000001 145 309 390 526 Gorai.012G038300.1 CE10 341 340 0 48 314 44 312 Gorai.012G066500.1 CE10 341 294 0.00014 146 276 120 212 Gorai.006G269800.1 CE10 341 396 0.0000034 146 291 120 227 Gorai.006G269800.2 CE10 341 383 0.00005 146 208 120 176 Gorai.006G269800.2 CE10 341 383 0.00005 17 64 267 314 Gorai.006G269800.3 CE10 341 379 0.0000028 146 289 103 208 Gorai.006G269800.3 CE10 341 379 0.0000028 16 64 262 310 Gorai.006G146700.1 CE10 341 332 0 75 333 50 326 Gorai.006G038400.1 CE10 341 446 0 54 335 111 434 Gorai.006G245500.1 CE10 341 831 2.2e-28 91 315 592 813 Gorai.006G245500.2 CE10 341 764 0.000000000000002 91 221 592 726 Gorai.006G245500.3 CE10 341 730 1.7e-28 91 315 491 712 Gorai.006G245500.4 CE10 341 714 1.7e-28 91 315 475 696 Gorai.006G245500.5 CE10 341 574 1.1e-28 91 315 335 556 Gorai.006G103400.1 CE10 341 511 0.00097 170 215 189 248 Gorai.006G117200.1 CE10 341 363 0 71 326 54 320 Gorai.006G117200.2 CE10 341 331 0 71 331 54 325 Gorai.006G237000.1 CE10 341 324 0 61 333 38 322